南方科技大學(xué)以建設(shè)高水平研究型大學(xué)為辦學(xué)目標(biāo)，力爭成為我國科研與拔尖創(chuàng)新人才培養(yǎng)的一個重要基地。按照南方科技大學(xué)的教學(xué)模式和科研架構(gòu)，在滿足本科生、研究生教學(xué)的前提下，為南方科技大學(xué)引進的科研人才提供國際一流的科研設(shè)備，以充分發(fā)揮和挖掘他們的創(chuàng)新科研能力。通過和國內(nèi)相關(guān)企業(yè)的密切合作，為相關(guān)企業(yè)提供技術(shù)支持和服務(wù)，實現(xiàn)產(chǎn)學(xué)研良性互動，在南方科技大學(xué)建立起國際一流的公共教學(xué)和研發(fā)技術(shù)平臺。
為致力于辦好具有國際水平的大學(xué)，南方科技大學(xué)將開創(chuàng)鮮明的辦學(xué)特色。從辦學(xué)體制上多創(chuàng)新，管理上去行政化，教學(xué)上注重學(xué)生的實踐能力和科研能力培養(yǎng)，其中很重要的一點是：本科學(xué)生進校不分專業(yè)，大一大二進行基礎(chǔ)理論課學(xué)習(xí)，大三大四根據(jù)個人興趣選擇專業(yè)和老師，在老師和具體科研項目的指引下進研究中心的實驗室做實驗課題，從實驗中鞏固理論知識，從實驗中完成科研項目，解決具體實際問題，實現(xiàn)創(chuàng)新。
南方科技大學(xué)計劃建設(shè)9個研究中心，分別為：
（1）太陽能研究中心；
（2）神經(jīng)與認知科學(xué)研究中心；
（3）機器人與人工智能研究中心；
（4）生物與基因工程研究中心；
（5）未來城市研究中心；
（6）材料性質(zhì)調(diào)控及應(yīng)用研究中心；
（7）微納尺度上的科學(xué)和工程研究中心；
（8）環(huán)境科學(xué)與污染控制研究中心；
（9）大規(guī)模計算材料與基礎(chǔ)材料研究中心。
通過配置一流的創(chuàng)新型人才與國際領(lǐng)先的研發(fā)儀器，從而使南科大躋身成為亞洲一流的培養(yǎng)創(chuàng)新人才的研究型大學(xué)。
（一）材料性質(zhì)調(diào)控及應(yīng)用(Control and Modification of Materials and Applications)
（二）微納尺度上的科學(xué)和工程(Nanoscience and Nanotechnology)
（三）太陽能研究中心(Solar Energy Research Center)
（四）生物與基因工程(Biotechnology and Genetic Engineering)
研究中心將面向各系，除了給各系的教授們提供先進的科研設(shè)備和條件用于他們的科研創(chuàng)新，各研究中心還要承擔(dān)上述院系的三，四年級本科生的實驗課程的訓(xùn)練，培養(yǎng)和引領(lǐng)他們到科學(xué)的前沿陣地，按照學(xué)生們的興趣，選拔進各研究中心參與科研項目，拓寬他們的國際視野，成為大學(xué)生人才的孵化基地。譬如研究中心在配合學(xué)生教學(xué)（課程）方面，可以做到：
（一）為高年級本科學(xué)生及研究生開設(shè)相關(guān)的專業(yè)課程（包括實驗課程，另見專題報告二）,學(xué)生還可在該研究中心完成大學(xué)本科或研究生畢業(yè)論文.同時鼓勵南科大學(xué)生積極參與國際大學(xué)生研究發(fā)明競賽,并為之提供相關(guān)理論指導(dǎo)和研發(fā)設(shè)施；
（二）吸引國際訪問交換生（外國及港澳臺地區(qū)）到該中心訪問學(xué)習(xí),并提供相關(guān)領(lǐng)域的科研訓(xùn)練；
（三）為本地區(qū)企業(yè)研發(fā)部門的年青科技人員提供科研指導(dǎo)和咨詢。
研究中心主要研究方向，及開設(shè)高年級本科生及研究生相關(guān)專業(yè)的課程（包括實驗課程），按照系別分類如下：
物理系
•表面科學(xué)
•半導(dǎo)體光學(xué)
•激光應(yīng)用
•超導(dǎo)物理
•介觀物理
•金屬氧化物半導(dǎo)體
•計算物理
•拓撲絕緣體和拓撲超導(dǎo)體
•超冷原子系統(tǒng)
•光催化在能源和環(huán)境中的應(yīng)用
化學(xué)系
•生物無機化學(xué)
•化學(xué)生物學(xué)
•有機合成與不對稱催化
•功能高分子材料
•有機光電材料
•無機光化學(xué)
•蛋白質(zhì)晶體工程
•質(zhì)譜分析技術(shù)
•無機納米功能材料
•藥物傳輸與緩釋技術(shù)
微納材料與器件系
•有機物半導(dǎo)體材料和器件
•寬禁帶半導(dǎo)體材料和器件
•自旋電子學(xué)
•納米刻印技術(shù)研究與開發(fā)
•新型能源材料的研究與開發(fā)
•納米材料力學(xué)
•電子顯示技術(shù)的開發(fā)與利用
•納米尺度CMOS器件與工藝
•半導(dǎo)體低維量子結(jié)構(gòu)
•超快激光物理，非線性光學(xué)，強激光和物質(zhì)的作用
生物系
•生物信息學(xué)
•基因組學(xué)
•生物物理學(xué)
•生物分子納米結(jié)構(gòu)與生物感測
•生理學(xué)
•生物化學(xué)
•基因工程
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